El Castillo-Palacio de Magalia es uno de los pocos castillos rocosos que se conserva hoy en pie. Parte de sus muros están hechos con roca virgen, la roca natural sobre la que se asienta la construcción, hecho que puede verse en una de las esquinas del patio porticado. 

También destaca por acoger algunas rarezas arquitectónicas, como las dos bóvedas planas de la torre de la biblioteca. Anteriores a las del Monasterio de El Escorial, estas bóvedas eran tan singulares, que Felipe II se negó a que Juan de Herrera las construyera en el monasterio por temer que pudieran desplomarse. 

En general, el edificio responde a los modos de hacer del Renacimiento, aunque en su conjunto se aprecian numerosos elementos de otros periodos, desde vestigios arquitectónicos de origen romano (como un cipo funerario) hasta pinturas cubistas del siglo XX presentes en la capilla, pasando por galerías de estilo gótico mudéjar o escudos medievales labrados en la piedra. 

El Castillo Palacio de Magalia cuenta con diversas obras en depósito pertenecientes al Museo del Prado, entre las que destacan los óleos “Carreta de bueyes” de Ramón Bayeu, la serie de “La Caza” de José del Castillo, o “El Invierno” de Jacopo Amigomi. Además, en su propio patrimonio cuenta con obras artísticas de gran valor como los “Naipes” de Pancho Cossío o la serie de “Las Cuatro Estaciones” de la pintora madrileña Rosario de Velasco.

Además de las obras pictóricas, Magalia alberga otros objetos de valor como un cipo funerario romano, un bargueño del siglo XVIII, un baúl de estilo gótico catalán, y varios relicarios, entre los que se encuentra uno con la firma manuscrita de Santa Teresa. La mayoría de las piezas están expuestas en el Salón de Honor del Castillo, al que puede accederse mediante las visitas guiadas que organiza el Ayuntamiento de las Navas del Marqués.